食品工廠潔凈車間工程設計、施工、驗收投入使用后，為保證食品工廠潔凈室在使用過程中始終保持規定的空氣潔凈度水平和綜合性能參數，或因食品工廠潔凈室投入使用后維護管理不當，或因食品工廠潔凈室工作人員誤操作及凈化空調系統長期運行，或因食品工廠潔凈室周圍環境突然變化，導致空氣過濾器性能發生變化，如房屋拆遷、潔凈室生產工藝調整、空氣粉塵污染突出甚至沙塵暴侵襲等因素，都會影響食品工廠潔凈室的性能參數，因此潔凈室投入運行后的日常監測和定期的綜合性能測試非常重要必要和重要的工作，潔凈室的綜合性能可通過試驗驗證，滿足設計要求或產品生產所需的綜合性能參數。
食品工廠潔凈室的定期綜合性能檢測目的是通過對空氣潔凈度等級等方面的監測、記錄，需掌握以下內容。
·確定正常運行
·掌握能量使用情況
·發現異常現象并維修
·查明發生污染問題的原因，弄清楚有關數據
·產品質量相關的資料
·潔凈室的缺點（運行上的缺點等）
食品工廠潔凈車間的認證程序如下
1、業主委托特殊檢查和認證單位進行食品工廠潔凈室的認證工作。委托可以是一次性的，也可以是階段性的，如一年期的委托合同，委托證明的內容、試驗要求（包括時間間隔等）、試驗證明報告的內容、要求的驗證試驗的時間安排、各方的責任（包括保密要求）等被指定。
2、測試和測試儀器必須在規定的有效期內。
3、在認證檢測前，潔凈室各功能系統應達到穩定運行，業主應提供穩定運行的相關記錄。
4、按照合同要求進行逐案檢測，并做好詳細記錄。記錄應清晰，并對測量情況或有關問題作出必要的說明。
5、編制認證測試報告，明確說明潔凈室是否符合規定要求，以及各項綜合參數的明確數據或計算結果。檢測結果超過規定限值，表明潔凈室不合格的，檢測認證單位應提出分析意見和改進建議，業主或業主委托的相關單位應在改進和改進后重新認證。
6、食品工廠潔凈室的每個認證或再認證，由檢驗和認證單位提供原始記錄和綜合性能測試證書報告。