給水處理的任務是根據原水水質和處理后水質要求，采用最適合的處理方法，使之符合生產和生活所要求的水質標準。食品工廠水質凈化系統可分為原水凈化系統和水質深度處理系統。如果使用自來水為水源，一般不需要進行原水處理。采用其他水源時常用的處理方法有混凝、沉淀和澄清，過濾、軟化和除鹽等。食品工廠工藝用水處理要根據原水水質和生產要求，采用不同的處理方式。產品用水、生活用水、除澄清過濾處理外，還需經消毒處理，鍋爐用水還需軟化處理。原水處理的主要步驟如下:
1、混凝、沉淀和澄清處理：主要是對含沙量較高的原水（例如長江、黃河水）進行處理。投加混凝劑（如硫酸鋁、明礬、硫酸亞鐵、三氯化鐵等）和助凝劑（如水玻璃、石灰乳液等），使懸浮物及膠體雜質同時絮凝沉淀，然后通過重力分離（澄清）。
混凝劑有濕法和干法兩種投配方式，國內一般多采用濕法，把混凝劑或助凝劑加水先調制成10％～20％（質量分數）的溶液后，再定量加注投配，使注入的藥劑在反應池中與原水急劇、充分地混合，發生混凝反應。所用的設備有反應池，原水在反應池中與混凝劑反應，形成絮凝沉淀后，再進入沉淀池，利用重力分離沉淀。反應池的形式有隔板式、渦流式和旋流式等。反應池形式與處理水量有關。一般情況下，處理量在30000m/d以上者（大型水廠），多選用隔板式反應池。其特點是構造簡單、管理方便、效果較好，其不足之處是容積大、反應時間長。處理量在20000m3/d以下者（中小型水廠），多選用渦流式或旋流式，也有選用隔板式的。反應時間一般在20～30min。沉淀池有平流式和立式之分，現在大多采用立式的機械加速澄清池、水力循環澄清池、脈沖澄清池等。平流式沉淀池因占地面積大，現一般不用。澄清后水質一般可達渾濁度20度以下。
2、過濾：原水經沉淀后一般還要進行過濾。過濾主要用以去除細小懸浮物質和有機物等。生產用水、生活飲用水在過濾后再進行消毒；鍋爐用水經過濾后，再進行軟化或離子交換。所以，過濾也是水處理的一種重要方式。過濾設備稱過濾池，其形式有快濾池、虹吸濾池、重力或無閥濾池、壓力式濾池等數種，都是借水的自重和位能差或在壓力（或抽真空）狀態下進行過濾，用不同粒徑的石英砂組成單一石英砂濾料過濾，或用無煙煤和石英砂組成雙層濾料過濾。
生產用水、生活飲用水還需進行消毒。用液氯或漂白粉加入清水池內進行濾后殺菌消毒；如水質不好，也有采用在濾前和濾后同時加氯的。消毒后水的細菌總數、大腸菌群等微生物指標和游離性余氯量都應達到生活飲用水標準。
3、清水池：處理后的清水貯存在清水池內。清水池的有效容積，根據生產用水的調節貯存量、生活用水的調節貯存量、消防用水的貯存量和水處理構筑物自用水（快濾池的沖洗用水）的貯存量等加以確定。這幾種不同情況的綜合水量決定了清水池的總容積。清水池的個數或分格至少有兩個，并能單獨工作和泄空。
為了滿足食品工廠工藝生產用水的要求而對滿足生活用水衛生標準的生產用水作進一步深度處理，常用的方法有活性炭吸附、微濾、電滲析、反滲透和離子交換等方法。水的深度處理通常與生產工藝緊密相關，有時就是生產過程的一部分，如礦泉水生產、純凈水生產、飲料生產等，具體方法可參考其他相關資料，此處不作詳細論述