藥廠廠區劃分就是根據生產、管理和生活的需要，結合安全、衛生、管線、運輸和綠化的特點，將全廠的建（構）筑物劃分為若干個聯系緊密而性質相近的單元，以便進行總平面布置。
藥廠廠區劃分一般以主體車間為中心，分別對生產、輔助生產、公用系統、行政管理及生活設施進行歸類分區，然后進行總平面布置。
一、生產車間 藥廠廠內生產成品或半成品的主要工序部門，稱為生產車間，如原料藥車間、制劑車間等。生產車間可以是多品種共用，也可以為生產某一產品而專門設置。生產車間通常由若干建（構）筑物（廠房）組成，是全廠的主體。根據工廠的生產情況可將其中的1～2個主體車間作為廠區布置的中心。
二、輔助車間 協助生產車間正常生產的輔助生產部門，稱為輔助車間，如機修、電工、儀表等車間。輔助車間也由若干建筑物或廠房組成。
三、公用系統 公用系統包括供水、供電、鍋爐、冷凍、空氣壓縮等車間或設施，其作用是保證生產車間的順利生產和全廠各部門的正常運轉。
四、行管區 由辦公室、汽車庫、食堂、傳達室等建（構）筑物組成
五、生活區 由職工宿舍、綠化美化等建（構）筑物和設施組成