窗是用于室內采光和通風的主要結構之一，有側窗和天窗兩類。側窗開在四周墻壁上，是透光的主要部分。常見側窗的形式有平開窗、中懸窗、固定窗、垂直旋轉窗等。側窗面積大，通常采用組合形式側窗，即高處為中懸窗、中部為固定窗、低處為平開窗。寒冷地區和要求隔熱的加工間應設置雙層玻璃窗。工人坐著工作時，窗臺高可取800～900mm；站著工作時可取1000～1200mm。管制生產區的室內窗臺、臺面深度如有20mm以上的，其臺面與水平面的夾角應達45以上，未滿20mm的應用不透水材料填補內面的死角。食品工廠加工車間的側窗通常用鋁合金架玻璃窗，耐用、衛生、美觀。
生產中需要打開的窗戶應裝設易拆卸清洗且具有防護蚊蟲等污染的不生銹紗網窗，但清潔生產區內在生產時不得打開窗戶。在窗前布置設備時，要求窗能開啟方便、空氣流通順暢、設備維修方便。
在大跨或多跨的食品工廠中，為獲得較均勻的采光，食品工廠廠房頂部常常需要設置天窗。有的車間為了通風和排除高濕余熱也要設置天窗。常見的天窗形式包括矩形天窗、三角形天窗、鋸齒形天窗、平天窗、井式天窗等天窗盡量利用自然通風或在天窗處再安置排風機加強通風。
采用矩形天窗結構較簡單、通風性好，安置擋風板的矩形天窗通風效果更好。矩形天窗寬度為廠房跨度的1/3～1/2，高度為窗寬的0.3～0.5倍，窗寬較大時可設計成分段式天窗。窗扇為上懸式或中懸式，前者開啟角45°，后者開啟角60°～80°。應安置窗扇開啟器，防蟲、鼠網，防水和排水的天窗側板，檐口等構件。天窗一般宜采用鋼質材料做框架，并應涂覆防銹、防腐蝕的涂層，配3mm玻璃。
工業生產車間采光要求分為5級，肉類加工廠的采光應達到3級，即在此采光要求下，可識別＞0.3mm和＜1.0mm的對象。農產品加工廠采光應達到4級，即在此采光要求下，識別＞1.0mm和＜5.0mm的對象。為了達到要求的采光級別，廠房應有相應的采光面積。