制藥廠設備的安裝驗證是為保證事先確定的設計參數的達標。項目建設期，建造、安裝的步驟和方法一定要加以控制以保證施工前確認的材料、設備配件與設計的一致性；施工過程與施工規程的一致性；竣工圖與設計圖的一致性；建造階段與竣工后清洗操作與清洗規程的一致性；按制藥廠設計的要求調試設備校驗儀表（器）；按GMP要求做好記錄。
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一、制藥廠設備結構材料確認
系統的主要設備，蒸餾水器、過濾器、電滲析、離子交換器、水泵和貯水罐等在采購時或供應商發運前要進行檢查運行功能和特性應與規范保持一致，而且任何偏差都應得到糾正。設備一到應立即檢查，確定運輸有無損壞及散失。管道、貯水罐、蒸餾水機、純蒸汽發生器、注射用水水泵采用316L或不銹鋼材料，電拋光并鈍化處理。閥門采用不銹鋼聚四氟乙烯隔膜閥。隔膜可將介質與閥門的其他組件隔離，密封效果好，易清潔、易更換。膜分離技術在制藥工藝用水中的應用越來越普遍，如電滲析膜、微孔濾膜、反滲透膜、超濾膜，安裝前必須確認其完整性和規格的適用性。
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二、制藥廠設備安裝
對照設計圖紙，將水處理設備就位。管道的連接用氬弧焊、對接焊或撞擊焊，內壁拋光處理，記錄焊接過程及控制參數（電流大小、頻率等）。采用卡箍式快裝不銹鋼管道，以便清洗和安裝。管路安裝有適度傾斜，不用時管道內能排空積水。管道采用循環布置，系統循環回水流入貯罐，無盲管。裝有除菌呼吸過濾器，使用點裝閥門處的長度，加熱系統不得大于6倍管徑，冷卻系統不得大于4倍管徑。閥門、水泵用衛生夾頭連接。蒸餾水機冷凝器上排氣口必須安裝孔徑0.22膜過濾器，貯水罐通氣口應安裝不脫落纖維的疏水性除菌濾器，并可以加熱消毒。
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三、制藥廠設備安裝后的清洗鈍化、消毒
①純水循環沖洗。在貯液罐中注入足夠常溫純水，用水泵打循環，15min后打開排水閥，邊循環邊排放，沖洗系統去塵埃和其他臟物。
②堿液沖液。以10％NaOH溶液，保溫70℃以上循環沖洗30min以上后排放，去除油脂或油污。再改用純水沖洗，直至各出口點水的電阻率與純水電阻率相一致，沖洗排放持續時間不少于30min。
③鈍化。用8％的HNO3水溶液或3％HF＋20％HNO3水溶液在49～50℃下循環60min后排放，酸既可起到鈍化不銹鋼作用，還可溶解系統中的亞鐵顆粒。鈍化后用純化水沖洗，直到出口點水的電阻率與純水一致。最后是消毒，將潔凈蒸汽通入整個系統，每個使用點至少15min，消毒溫度121℃。
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四、制藥廠水處理設備安裝確認
水處理系統安裝確認所需的文件包括:系統的流程圖、設備布置圖、水處理設備及管道安裝調試記錄；儀器儀表的檢定記錄；設備的規格說明書、設備操作手冊及標準操作、維修規程（SOP）。主要內容如下。
1、對照竣工圖和設計圖及供應商提供的技術資料，檢查安裝是否符合設計要求和規范以及儀表的校正及操作、閥門和控制裝置是否正常、維修規程的編寫等。確認校正的儀表和控制器，如流量計、電導儀、溫度計、壓力表，使其起到監測和控制作用。檢查設備調試記錄，確認SOP草案。
2、根據生產要求檢查水處理設備和水、電、氣、汽等管道系統的安裝是否合格，管線與儀表、過濾器等連接情況。水管焊接質量，除做X光拍片檢查外，還要做靜壓試驗。試驗壓力為工作壓力的1.5倍，以無滲漏為合格。對于管道及分配系統要確認管道的材質、連接與試壓、清洗鈍化與消毒。
3、純水設備、蒸餾水機試運行情況。測試設備的參數和系統各功能作用。化驗分析每臺設備進、出口點水質，來確定該設備處理水的效率、產量是否符合設計要求。例如離子交換樹脂，檢查其牌號、交換能力、再生周期、再生用酸堿濃度以及每次用量和自動反沖情況，測定出水的電阻率、流量、pH值、Cl離子含量。
4、貯水罐應檢查加熱、制冷、保溫和循環情況，通氣過濾器膜的完整性（測定起泡點），中0.22m濾膜起泡點壓力不小于0.4MPa。