對于藥廠設計來說，大部分系統需要加熱，但并非完全需要，潔凈室則有克服最高負荷的冬季或重加熱的需要。重要的加熱負荷有:
（1）新風。新風必須加熱，以防空間過冷。
（2）廠房負荷。是指冬季對墻、屋頂等的傳導負荷，雖然相當小，但最好由 ASHRAE方法計算。一般可采用近似值進行計算。
（3）再加熱。如果空氣量和溫度所選擇的最高負荷去濕不相配于所需顯熱的冷卻，則需要再加熱。
（4）加濕。能量用于產生蒸汽來加濕。
對大型潔凈室裝置，其加熱方法承擔了主要能量費用。在藥廠設計中，大裝置需要大量的新鮮空氣和或重加熱,最簡單的加熱方法是采用電阻加熱器；然而它通常對生產每單位熱量的能量費用是最貴的。對于大型裝置，由天然氣或原油燃料鍋爐生產是最有效的加熱方法。
在藥廠設計中，加濕是另一種應予以研究的方法，如果需要高負荷，選擇電極鍋爐加濕器（如霧化或氣體燃燒蒸汽鍋爐）可產生明顯的節約效果，在能量設計的主要點，如果高度加熱和加濕負荷時應采用一般蒸汽鍋爐，因為它們通常只需很少的初投資和操作費用。