醫藥工業潔凈廠房中工藝設備及管道繁多，為了防止在生產設備和工藝管道中產生、積聚微粒及微生物，同時確保設備、管道系統能安全可靠地投入生產，在設計、安裝等方面應采取相應的措施。下面華盛興邦談下藥廠設計對設備、管道的設計要求。
在藥廠設計中，為防止藥液或物料在設備、管道內滯留而造成微生物滋長，設備內壁應光滑，無死角，管道設計要減少支管、管件、閥門和盲管。同時，對需要清洗、滅菌的零部件應易于拆裝，不便拆裝的要設清洗口，且無菌室的設備、管道應滿足滅菌需要。管道連接也要考慮拆洗方便，但不宜采用絲口連接，以避免物料在絲口處沉積，若采用法蘭連接時宜使用不易積液的對接法蘭、活套法蘭。
輸送純水、注射用水的管道應保持循環，宜采用環形干線，支管宜設回流管路，以便不用時注射用水可回流至主干管，防止水在支管內滯留而滋生細菌。
在藥廠設計給排水系統時，應遵循以下基本要求：
（1）在藥廠設計中，廠房內的給水排水干管應布置在技術夾層、技術豎井、地溝管槽內，引潔凈室的支管宜暗敷，且給水排水管道穿過潔凈室頂棚、墻壁、樓板處應采取可靠的密封措施。
（2）在藥廠設計中，建筑物內各種給水管道宜豎向布置，在靠近用水設備附近橫向引入，從豎管上引出的支管應盡可能短，一般不宜超過支管直徑的6倍，以防水在橫管上靜止滯留。
（3）在藥廠設計中，對不允許斷水的車間，給水引入管應設置兩條，在室內連成環狀或貫通枝狀雙向供水，引入管宜分設于室外環網的不同側。
（4）在藥廠設計中，排水系統應根據排出廢水的性質、濃度及水量等進行設計，并應根據不同情況采取廢水處理和綜合利用措施，且排水主管不應穿過潔凈度要求高的房間。
（5）100級的潔凈室內不宜設置地漏，10000級和100000級的潔凈室也應少設地漏。其地漏所用材質應不易腐蝕，內表面光潔，不易結垢，在構造上應設密封蓋，且開啟方便，能防止廢水廢氣倒灌，必要時還應能根據產品工藝要求消毒滅菌。
（6）潔凈室內與回水管道相連的設備、衛生器具和排水設備的排出口以下部位必須設水封裝置。
（7）潔凈廠房內應采用不易積存污物、易于清掃的衛生器具、管材、管架及其附件。同樣，閥門選用也以不積液的為好，不宜使用普通截止閥、閘閥，宜使用清洗、消毒方便的旋塞閥、球閥、隔膜閥、衛生蝶閥、衛生截止閥等。