對于藥廠設計來說，設計潔凈的空調系統具有重要的作用，并且為藥品的生產提供潔凈的環境是制藥企業做的基礎事情。隨著空調系統技術的發展，以及出現新版的 GMP，制藥企業對空調系統的潔凈度有越來越高的要求，在藥廠設計中，對于潔凈空調系統的優化設計的難度不斷增大。但是對于潔凈空調系統方案的設計的可選方案也越來越多。下面我們主要研究潔凈空調系統的優化設計，不僅具有理論意義，還具有重要的現實意義。
一、凈化級別與換氣次數的問題。在藥廠設計中，潔凈級別具有重要的保障作用，潔凈級別的大小在潔凈空調系統中具有重要的保障作用。其主要表現在對過濾效率、新風、換氣次數、和車間內空氣的含塵的濃度等方面。除此之外，為了避免壓差梯度調節困難，還要對排風和回風系統的風口風速的選擇進行優化，從而實現最佳的壓差分布，更好實現工藝的要求，還有在片劑車間空調中都設有除塵通風系統，例如，一些易致敏的品種，激素類和抗生素類藥必須選擇過濾效率和密封程度較高的產品，從而優化除塵和排風系統的高效過濾器的選擇，從而達到環保的排放標準，否則，會影響排除空氣的潔凈程度。為了減少制藥企業潔凈空調系統投資的成本，同時滿足各個階段風量的需求，要對通過變頻控制的范式來凈化機組，并且優化管道，從而降低能源的消耗。并且以上所有的工作都要在符合制藥的條件的要求下進行。
二、不合理的風管管路設置。在藥廠設計中，調節閥的使用會產生很大的噪音，而且會還會給各支風量的調節造成困難，主要是因調節閥主要設置在空調機組、新風口和回風口除外，會產生很大的風力。因此，在空調系統中逐漸應用定風量閥，逐漸解決了送風量調節帶來的弊端，但是其主要應用到藥廠較高的項目采用中，因為其造價相對高貴。
以上就是藥廠設計之潔凈空調系統可能存在的問題，在實際的設計過程中，我們需要根據實際情況來解決。