制藥廠凈化車間的空調凈化系統運行能耗比一般舒適性空調運行能耗大得多，根據凈化級別不同，制藥廠凈化車間空調凈化能耗是一般舒適性空調能耗的 1.5~15 倍，其單位面積的耗電量為 0.1~1.0Kw/m2。
一、制藥廠凈化車間的主要能耗
① 為維持制藥廠凈化車間所要求的溫度和相對濕度，要對潔凈室的送風進行必要的熱、濕處理（冷卻、去濕、加熱、加濕 ……），就必須向空調凈化系統供冷供熱，供蒸汽就要消耗大量的能量。
② 為了保證制藥廠凈化車間的潔凈度，溫度、濕度等參數，必須往潔凈室送入大量的空氣，送風的風機和供水的水泵等動力設備也要消耗可觀的能量。
③ 上述的供冷、供熱、供蒸汽消耗的能量以及送風、送水設備消耗的電量隨潔凈級別越高，能量消耗越大。
④ 制藥廠凈化車間的冷負荷中的主要負荷是新風冷負荷，消除工藝設備和工藝過程產熱的冷負荷和抵消風機和水泵發熱的冷負荷，這三項負荷占總冷負荷的90%以上；而圍護結構、照明和作業人員三項冷負荷不足總冷負荷的 10%。
二、制藥廠凈化車間能耗大的原因
① 凈化送風量大。不同凈化級別的潔凈室送風量和相同面積的舒適空調送風量的相比是其1.5~55 倍 ，而且送風風壓也是其 2~3 倍 ，因此送風機的溫升耗冷量很大。
② 制藥廠凈化車間空調凈化系統的新風量大，一般情況下，新風量等于排風量與正壓漏風量之和，因此生產工藝排風量大故新風量就很大。因此，新風的熱濕處理耗能也就很大。
③ 制藥廠凈化車間中的工藝設備和工藝過程發熱量大，而且連續兩班制或三班制運行。因此，耗能量也大。
④ 制藥廠凈化車間內生產工藝的溫、濕度及其精度要求很高、很嚴。也是能耗大的原因。
三、制藥廠凈化車間的節能
① 嚴格控制制藥廠凈化車間的設計參數（潔凈度和溫濕度）和潔凈室的面積尤其是 10 級、100級這樣的高級別單向流潔凈室的面積。因為潔凈級別越高，溫濕度精度要求越高，單位面積能耗越大。因此，實事求是該高則高，不要無原則地提高要求。潔凈室的面積不要留太大余地。尤其是高級別的潔凈室面積盡量采用混合流以低級別潔凈室代替高級別潔凈室。盡量縮小 10 級、100級單向流潔凈室的面積。
② 嚴格控制制藥廠凈化車間的凈化送風量，不要留太大的安全系數。控制監督施工質量，減少潔凈室和管道的漏風量，加強保溫減少冷損失，提高設備效率盡量利用變頻措施以利節能。
③ 嚴格控制新風量。盡量降低排風量，采取措施提高排風效果，降低排風量以減少新風空調處理的能耗。
④ 加強管理。減少跑、冒、滴、漏。充分利用熱回收和天然能源做為空調系統的預冷和預熱。